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KEGG - Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, as part of the research projects in the Kanehisa Laboratory of Kyoto University Bioinformatics Center.

Metabolic Design and Genome Analysis at Integrated Genomics - Genome structures, annotated genomes, their encoded metabolism, comparative pathway analyses, and more, are available for licensing.

Boehringer Mannheim, Biochemical Pathways - This page gives access to the digitized version of the Roche Applied Science "Biochemical Pathways" wall chart.

Bioinformatics Group at MCS ANL Projects - High throughput comparative and evolutionary analysis of Genomes and metabolic networks with Grid computational backend. PUMA2 - a system for High-throughput analysis of genomes and metabolic reconstructions from the sequence data. Currently PUMA2 contains 1034 genomes and allows interactive analysis of the sequence data using a variety of bioinformatics tools.
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