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Microarrays.org - a public source for microarray protocols and software

Microarray Informatics at the EBI - microarray informatics group at the EBI addresses the problem(s) of managing, storing and analysing microarray data

.: Databases

Stanford Microarray Database - stores raw and normalized data from microarray experiments, and provides data retrieval, analysis and visualization interfaces. Data is released to the public upon publication.

ArrayExpress European Bioinformatics Institute (EBI)

ChipDB - Whitehead Institute for Biomedical Research/MIT Centre for Genome Research

Dragon - Johns Hopkins University

ExpressDB - Harvard University. Public queries of E. coli and yeast data

Expression Connection - Stanford University/Saccharomyces Genome. Database public queries of yeast data

GeNet Silicon Genetics

Gene Expression Omnibus - a high-throughput gene expression / molecular abundance data repository, as well as a curated, online resource for gene expression data browsing, query and retrieval

The Gene Expression Database (GXD) - a community resource for gene expression information from the laboratory mouse

yMGV Yeast Microarray Global Viewer - Ecole Normale Superieure. Public queries of yeast data. yMGV is an on-line database providing a synthetic view of the transcriptional expression profiles of yeast genes among most of the published expression dataset

.: Software & Tools

Stanford Microarray Database - restech

YFleung's Functional Genomics - An extensive collection of links pertaining to hardware, software, protocols, and more
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